CRYSIS 2 navazuje na předchozí 2 díly Crysis ve kterých se na zemi dostali mimozemšťani. Hrajete za člena jednotky
Marine Force Recon jménem "ALCATRAZ", který získá od jedné z hlavních postav předchozího dílu Laurence Barnese (Proroka)
nanooblek druhé generace. Jednotky CryNet Systems s označením C.E.L.L., které předtím pronásledovaly Proroka nakaženého
virem Manhattan, za účelem získání obleku. ALCATRAZE loví v mylné domněnce, že je Prorok. Mimozemšťané, které
jste mohli vidět v původní hře prošly celkovým přepracováním. Opustili staré, exosuity z prvního dílu a v díle druhém
už mají k dispozici high-tech humanoidní obrněné válečné stroje (jejich slabinou se tedy stávají organické části hlavně
v oblasti „krku“), které znesnadňují ALCATRAZŮV pochod přes zničený New York. Vývojáři z Crytek před vydáním uvedli, že
jejich záměrem bylo překonat původní hru graficky a hratelností, přičemž zachovat stejné nebo dokonce nižší požadavky
na systém a také podporovat stereoskopické 3D.